La missione della Fraternità san Carlo a Praga apre i battenti nel 2002 quando don Stefano Pasquero, all’epoca ancora diacono, sbarca nella città ceca per imparare la lingua. Nel 2003 lo raggiunge don Andrea Barbero: nasce così il primo nucleo della casa. Nel 2009 arriva a Praga anche don Marco Basile. Oggi, ai sacerdoti della Fraternità san Carlo è affidata la parrocchia di Sant’Apollinare. Nel giugno 2019 raggiunge la casa anche don Marek Milkulastik.

La missione dei sacerdoti è strettamente legata all’accompagnamento della comunità di Cl nella Repubblica Ceca.